南方根结线虫伴生细菌宏基因组fosmid文库构建及其特征分析

为了研究南方根结线虫与伴生细菌的互作及其伴生细菌多样性,采用碘海醇介质离心技术、SDS裂解法和酚/氯仿抽提法等构建了南方根结线虫Meloidogyneincognita伴生细菌宏基因组fosmid文库,并进行文库特征分析。结果表明,该文库包含3万个克隆,插入片段大小分布在30~45kb之间,平均长度为40kb左右;共计包含1171MbDNA;质粒在fosmid传代中稳定遗传,没有发现插入片段的丢失或重排。末端测序结果显示,文库中南方根结线虫序列占2.04%,细菌序列占44.90%,无同源序列占53.06%;南方根结线虫伴生细菌优势种群为Sphingopyxis属和代尔夫特菌属Delftia。