玉米黑粉菌cyp51基因上游调控区克隆及生物信息学分析

为探明玉米黑粉菌cyp51基因的表达调控机制,根据玉米黑粉菌cyp51基因cDNA的5'-序列,采用染色体步移技术,获得其5'-上游调控区序列,总长为490bp。利用NNPP分析软件预测转录起始位点,并采用TFSEARCH1.3软件分析转录因子结合位点。结果显示:转录起始位点位于上游134bp处;上游调控区不仅包含启动子的核心结构序列TATA盒(分别位于－30、－58、－318和－348bp处)和CAAT盒(分别位于－150、－161和－191bp处),亦包含多个转录因子结合位点,如AP-4、GATA-1、CdxA、Dfd和Oct-1等;在上游调控序列中嘌呤含量高,而且从－222bp处开始存在4个连续高嘌呤含量的热激转录因子特异性结合位点(HSE)。