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ISSN: 2333-9721
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稻曲病菌的SCAR标记及其PCR检测

, PP. 481-487

Keywords: 水稻,稻曲病菌,RAPD特异片段,SCAR标记,PCR检测

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Abstract:

为建立稻曲病菌Ustilaginoideavirens快速、灵敏的PCR早期检测技术，以S380为引物，对稻曲病菌和其它参试病原菌的DNA进行RAPD-PCR扩增。稻曲病菌RAPD特异片段经回收、克隆和测序后，根据序列用Primer5.0软件设计了特异性SCAR引物US-SF（5’-TCGCCTCAGACCTCAATC-3’）/US-SR（5’-GAGCCTCAAATGCCTTCC-3’）和巢式PCR引物US-NF（5’-AGCGTCTCCTGCAACC-AC-3’）/US-NR（5’-GAGCCTCAAATGCCTTCC-3’）。利用引物US-SF/US-SR通过常规PCR对供试稻曲病菌均可扩增出1条大小约257bp的清晰条带，对其它植物病原菌DNA的PCR产物均无扩增条带，最低可检测到1pg/μL的病菌基因组DNA；而利用引物US-SF/US-SR和US-NF/US-NR通过巢式PCR可从10fg/μL的病菌基因组DNA中扩增出1条大小约210bp的特异性条带。试验表明，巢式PCR检测灵敏度比常规PCR提高了100倍，且巢式PCR可从接菌的水稻幼颖和自然感染的谷粒中检测出稻曲病菌。

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