新疆三种葡萄病毒RT-PCR检测及序列分析

为研究新疆葡萄中沙地葡萄茎痘伴随病毒(Grapevinerupestrisstempittingassociatedvirus,GRSPaV)、葡萄斑点病毒(Grapevinefleckvirus,GFkV)及葡萄病毒A(GrapevinevirusA,GVA)的发生情况和新疆分离株系统进化关系,分别克隆3种病毒新疆分离株部分基因区域,应用RT-PCR对新疆64份葡萄样品中上述3种病毒进行检测,并进行系统进化分析.结果显示,GRSPaV、GFkV和GVA的检出率分别为31.3%、62.5%和25.0%.新疆GRSPaV分离株(KJ801847)与美国GRSPaV分离株(AY368590)同源性达96.59%;新疆GFkV分离株(KJ801846)与日本GFkV分离株(AB222861)及中国辽宁GFkV分离株(JF927942)的同源性分别为91.70%和91.03%;新疆GVA分离株(KJ801845)与波兰GVA分离株(JN860997)同源性为93.88%,与中国四川GVA分离株(HQ671655)及辽宁GVA分离株(FJ445220)的同源性分别为92.92%和89.53%.表明3种葡萄病毒在新疆发生比较普遍,且新疆分离株与国内其它地方的分离株存在较大差异.