丹参功能基因组学研究Ⅲ——丹参金属硫蛋白MT-2基因的分析

目的：获得丹参金属硫蛋白基因序列,并进行生物信息学分析和初步的表达特性研究。方法：利用cDNA芯片技术,从不同时期毛状根中获得目的基因。利用BLAST进行序列比对,ORFfinder寻找开放读码框,Prosite分析蛋白质的基本结构域。用半定量RT-PCR检测其在丹参组培苗根、茎、叶中的表达情况。结果：得到2个MT基因全长序列,分别编码80和79个氨基酸,具有Type2型金属硫蛋白的典型特征,分别命名为SmMT-2a和SmMT-2b,两者具有71.25%的同源性。半定量RT-PCR表明,MT基因在丹参组培苗根、茎、叶中均有转录水平的表达,叶中表达量高于根和茎。结论：首次得到丹参金属硫蛋白基因,为其功能研究提供了基础。