乌拉尔甘草HMGR基因cDNA的克隆与序列分析

目的:对乌拉尔甘草3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶(3-hydroxy-3methylglutaryCoAreductase,HMGR)的cDNA克隆并进行序列分析。方法:根据NCBI数据库中的豆科其他物种HMGR的cDNA保守区设计引物,利用同源扩增和cDNA末端快速扩增技术从甘草根中获得目的基因;利用BLAST进行序列比对,ORFFinder寻找开发阅读框,Prosite分析蛋白质的基本结构域,Clustalx比对已有HMGR的氨基酸序列,并构建进化树。结果:得到1个全长为1842bp的HMGR的cDNA序列,含有1722bp的开放阅读框(openreadingframe,ORF),编码573个氨基酸,具有HMGR家族的特异序列,推测的氨基酸序列与豌豆、蒺藜苜蓿的氨基酸序列一致性分别为84%,76%。结论:对甘草HMGR基因的cDNA进行了克隆,为进一步研究3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A在甘草酸生物合成途径中的作用提供了理论依据。