全部 标题 作者
关键词 摘要

OALib Journal期刊
ISSN: 2333-9721
费用:99美元

查看量下载量

相关文章

更多...

基于ITS2和psbA-trnH序列对细小种子类药材车前子的鉴定比较

Keywords: 车前子,混伪品,DNA条形码,ITS2,psbA-trnH

Full-Text   Cite this paper   Add to My Lib

Abstract:

为考察ITS2序列和psbA-trnH序列对车前子药材及其常见混伪品的鉴定能力,该研究对车前子2个基原物种及7种混伪品共71份样本进行了研究。采用MEGA5.1对获得的ITS2和psbA-trnH进行序列比对,计算种内和种间kimura2-parameter(K2P)遗传距离,并构建系统发育树。结果显示,车前和平车前的ITS2序列长度分别为199,200bp;两者的ITS2序列种内最大K2P遗传距离均小于与混伪品的最小种间K2P遗传距离;基于ITS2序列构建的NJ树中,车前、平车前及其混伪品都表现出良好单系性,都能相互明显区分。表明ITS2序列能将车前子药材与混伪品进行很好的区分。车前和平车前的psbA-trnH序列长度均为340bp,两者的psbA-trnH序列种内最大K2P遗传距离小于与混伪品的最小种间K2P遗传距离;基于psbA-trnH序列构建的NJ树结果显示,除大车前外,车前子药材与其余混伪品可以明显区分。因此,ITS2序列作为DNA条形码,车前子及其混伪品具有良好的鉴别能力,对保障车前子用药安全具有重要意义。

References

[1]  中国药典. 一部[S]. 2010:63.
[2]  陈政威,金朝阳.车前子样品中混伪品来源鉴定[J].时珍国医国药,2001,12(11):1000.
[3]  邱静帆,殷颖.车前子的药学研究及其应用[J].浙江中西医结合杂志,2002,12(1):55.
[4]  龚卉卉,汪娟,孙莉,等.车前子及其易混伪品的扫描电镜鉴别[J].中国野生植物资源,2012,31(6):49.
[5]  Han J P, Liu C, Li M H, et al. Relationship between DNA barcoding and chemical classification of Salvia L. medicinal herbs [J]. Chin Herb Med, 2010, 2(1):16.
[6]  陈士林,郭宝林,张贵君,等.中药鉴定学新技术新方法研究进展[J].中国中药杂志,2012,37(8): 1043.
[7]  陈士林,姚辉,宋经元,等.基于DNA barcoding(条形码)技术的中药材鉴定[J].世界科学技术--中医药现代化,2007,9(3):7.
[8]  陈士林,姚辉,韩建萍,等.中药材DNA条形码分子鉴定指导原则[J].中国中药杂志,2013,38(2):141.
[9]  陈士林. 中药DNA条形码分子鉴定[M].北京:人民卫生出版社,2012:14.
[10]  Keller A, Schleicher T, Schultz J, et al. 5.8S-28S rRNA interaction and HMM-based ITS2 annotation[J]. Gene,2009,430(1):50.
[11]  Tamura K, Peterson D, Peterson N, et al. MEGA5: molecular evolutionary genetics analysis using maximum likelihood, evolutionary distance and maximum parsimony methods[J]. Mol Biol Evol, 2011, 28(10):2731.
[12]  王隶书,李明洋,宋柏林,等.车前子多糖研究进展[J].时珍国医国药,2012,23(2):460.
[13]  王劭华,罗光明,曾金祥,等.中药车前子的化学成分及药理学研究进展[J].亚太传统医药,2008,4(9):133.
[14]  John F Kennedy. Structural data for the carbohydrate of ispaghula husk ex Plantago ovata forsk [J]. Carbohydr Res,1979,75:265.
[15]  罗焜,马培,姚辉,等.中药DNA条形码鉴定中的DNA提取方法研究[J].世界科学技术--中医药现代化,2012,14(2):1433.
[16]  Bi I V, Harvengt L, Chandelier A, et al. Improved RAPD amplification of recalcitrant plant DNA by the use of activated charcoal during DNA extraction[J]. Plant Breeding, 1996, 115:205.
[17]  Zeng J, Zou Y P, Bai J Y, et al. Preparation of total DNA from "recalcitrant plant taxa"[J]. Acta Bot Sin, 2002, 44(6):694.
[18]  王川易,郭宝林,肖培根.中药分子鉴定方法评述[J].中国中药杂志,2011,36(3):237.
[19]  Chen S L, Yao H, Han J P, et al. Validation of the ITS2 region as a novel DNA barcode for identifying medicinal plant species[J]. PLoS ONE, 2010, 5(1):e8613.
[20]  陈士林,宋经元,姚辉,等. 药用植物DNA 条形码鉴定策略及关键技术分析[J]. 中国天然药物,2009,7(5):322.
[21]  Yao H, Song J Y, Liu C, et al. Use of ITS2 region as the universal DNA barcode for plants and animals[J]. PLoS ONE, 2010, 5(10):e13102.
[22]  Pang X H, Song J Y, Zhu Y J, et al. Applying plant DNA barcodes for Rosaceae species identification[J]. Cladistics, 2011, 27(2):165.
[23]  Song J Y, Shi L C, Li D Z, et al. Extensive pyrosequencing reveals frequent intra-genomic variations of internal transcribed spacer regions of nuclear ribosomal DNA[J]. PLoS ONE, 2012, 7(8): e43971.
[24]  Gu W, Song J Y, Cao Y, et al. Application of the ITS2 region for barcoding medicinal plants of Selaginellaceae in Pteridophyta[J]. PLoS ONE, 2013, 8(6): e67818.

Full-Text

Contact Us

service@oalib.com

QQ:3279437679

WhatsApp +8615387084133