全部 标题 作者
关键词 摘要

OALib Journal期刊
ISSN: 2333-9721
费用:99美元

查看量下载量

相关文章

更多...

DNA条形码技术在常见中药材蛇类鉴别中的应用

Keywords: COⅠ,遗传距离,系统分类,乌梢蛇

Full-Text   Cite this paper   Add to My Lib

Abstract:

中药材的准确鉴别是中药材研究、生产和应用至关重要的一步。DNA条形码技术以线粒体细胞色素氧化酶Ⅰ亚基(COⅠ)基因序列作为标记,在中药材鉴别中的应用日益增多。研究应用DNA条形码通用引物扩增测序,探讨DNA条形码技术在常见中药材蛇类(6科15属19种共109个样品)鉴别的可行性,采用邻接法构建该类群分子系统发育树。结果表明,该片段的G+C平均量为43.9%,低于A+T平均量(56.1%)。基于Kimura双参数模型计算,白唇竹叶青、乌梢蛇和赤练蛇的种内平均遗传距离均大于2%。通过构建系统发育关系后进一步分析发现,白唇竹叶青一样品鉴别有误。乌梢蛇中的某些样品也可能存在鉴别有误,即原本是灰鼠蛇的可能被错误鉴定为乌梢蛇。造成赤练蛇种内遗传距离差异大的因素需进一步分析。DNA条形码用于常见中药材蛇类种间的鉴别是可行的,极大程度地弥补统形态学分类方法的缺陷,值得加大推广应用和进一步深入研究。

References

[1]  秦秋.药用动物真伪鉴别将有可靠依据,药用动物DNA条形码研究启动[J].中医药管理杂志,2010,18(9):819.
[2]  Hebert P D, Cywinska A, Ball S L, et al. Biological identifications through DNA barcodes [J]. P Roy Soc Lond B Bio, 2003, 270:313.
[3]  崔丽娜,杜鹤,张辉,等.基于COⅠ条形码序列的金钱白花蛇及其混伪品的DNA 分子鉴定[J].世界科学技术——中医药现代化,2011,13(2):424.
[4]  崔丽娜,杜鹤,张辉,等.基于COⅠ条形码序列的龟甲及其混伪品的DNA 分子鉴定[J].吉林中医药, 2012,32(2):176.
[5]  胡嵘, 杜鹤, 崔丽娜, 等.海马、海龙基于COⅠ条形码的DNA 分子鉴定[J].吉林中医药,2012,32(3):272.
[6]  杜鹤,崔丽娜,张辉,等.鳖甲及其混伪品的DNA 分子鉴定[J].世界科学技术——中医药现代化,2011, 13(2): 429.
[7]  Gu H F, Xia Y, Peng R, et al. Authentication of Chinese crude drug gecko by DNA barcoding [J]. Nat Prod Commun, 2011, 6(1):67.
[8]  杜鹤,崔丽娜,张辉,等.基于COⅠ序列的蛤壳及其混伪品的DNA 分子鉴定[J].吉林中医药,2012,32(1):55.
[9]  杜鹤,孙佳明,崔丽娜,等.基于COⅠ条形码的麝香及其混伪品的DNA 分子鉴定[J].吉林中医药,2011,31(5):451.
[10]  杜鹤,崔丽娜,姚辉,等.基于COⅠ条形码序列的珍珠母及其混伪品的DNA 分子鉴定[J].中国现代中药,2011,13(11):12.
[11]  李丕鹏,王维胜,吕晓平.中国蛇类保护和利用概述:历史、现状和未来[J]. 沈阳师范大学学报:自然科学版, 2013,31(1): 129.
[12]  陈仁寿.浅析《本草纲目》蛇的药用[J].南京中医药大学学报:自然科学版,2000,16(2):309.
[13]  中国药典.一部[S]. 2010.
[14]  杨仓良. 动物本草[M]. 北京:中医古籍出版社, 2001.
[15]  李军德,黄璐琦,曲晓波. 中国药用动物志[M]. 2版.福州:福建科学技术出版社,2013.
[16]  Wiens J J, Hutter C R, Mulcahy D G, et al. Resolving the phylogeny of lizards and snakes (Squamata) with extensive sampling of genes and species [J]. Biol Lett-UK, 2012, 8(6):1043.
[17]  Folmer O M, Black W, Hoeh R. DNA primers for amplification of mitochondrial cytochrome C oxidase subunit I from metazoan invertebrates [J]. Molec Mar Biol Biotechnol, 1994, 3(5): 294.
[18]  Hall T A. BioEdit: a user-friendly biological sequence alignment editor and analysis program for Windows 95/98/NT [J]. Nucl Acids Symp Ser, 1999, 41: 95.
[19]  Tamura K, Stecher G, Peterson D, et al. MEGA6: molecular evolutionary genetics analysis version 6.0 [J]. Mol Biol Evol, 2013, 30: 2725.
[20]  Kimura M. A simple method of estimating evolutionary rate of base substitutions through comparative studies of nucleotide sequences[J]. J Mol Evol, 1980, 16(2): 111.
[21]  Nei M, Kumar S. Molecular evolution and phylogenetics[M]. NewYork: Oxford University Press,2000.
[22]  Posada D, Crandall K A. Selecting the best-fit model of nucleotide substitution[J]. Syst Biol, 2001, 50:580.
[23]  Luo A, Qiao H, Zhang Y, et al. Performance of criteria for selecting evolutionary models in phylogenetics: a comprehensive study based on simulated datasets[J]. BMC Evol Biol, 2010, 10: 242.
[24]  Darriba D, Taboada G L, Doallo R, et al. jModelTest 2: more models, new heuristics and parallel computing[J]. Nat Methods, 2012, 9(8):772.
[25]  Saitou N, Nei M. The neighbor-joining method: a new method for reconstructing phylogenetic trees[J]. Mol Biol Evol, 1988, 4:406.
[26]  崔志伟,王康才,郑晖,等. DNA条形码序列对不同品种金银花的鉴定[J].江苏农业科学,2013, 41(8):43.
[27]  程新玮,赵焕新,宁康,等.DNA条形码技术在中药质量评价中的研究进展[J].食品与药品,2013,15(4):295.
[28]  Avise J C. Phylogeography: the history and formation of species[M]. Cambridge: Harvard University Press, 2000.
[29]  Cao S P, Guo L N, Luo H M, et al. Application of COⅠ barcode sequence for the identification of snake medicine (Zaocys)[J]. Mitochondrial DNA, 2014,23:1.

Full-Text

Contact Us

service@oalib.com

QQ:3279437679

WhatsApp +8615387084133