谷子肌动蛋白基因的克隆及序列分析

？以谷子（Setariaitalica）为材料，提取总RNA。根据植物肌动蛋白基因编码区的两端的保守序列设计了简并引物，用5'RACE方法扩增出了谷子肌动蛋白基因编码区序列。以豌豆肌动蛋白cDNA作探针进行的Southern杂交分析表明扩增出了目的基因。将所获得的片段克隆到T载体后进行测序，序列分析结果表明：谷子肌动蛋白基因的编码区长1131个核苷酸，编码了377个氨基酸；所得序列(命名为MIAc)与GenBank中注册的肌动蛋白基因序列的相似性均在60%以上，与其它肌动蛋白氨基酸序列的相似性达89%以上。根据高等植物肌动蛋白序列相似性重建了进化树，表明谷子肌动蛋白与水稻肌动蛋白异型体RAc2和RAc3之间的亲缘关系最为密切，在进化过程中分化时间最为接近。