降解组测序技术在植物miRNA研究中的应用

？目前,利用芯片技术和miRNA测序可快速、准确地检测到物种中所含有的miRNA。随着越来越多的miRNA被发现,miRNA靶基因的确定已成为研究miRNA生物学功能的关键。传统的miRNA靶基因的寻找主要依赖生物信息学预测、AGO蛋白免疫共沉淀和荧光素酶法等。随着高通量测序技术的持续革新,出现了一种新的miRNA靶基因的检测方法,即降解组测序(degradomesequencing)法,该方法拥有高通量测序技术、生物信息学分析和RACE验证三者的优势,并已成功应用于拟南芥(Arabidopsisthaliana)、水稻(Oryzasativa)和小立碗藓(Physcomitrellapatens)等模式植物miRNA靶基因的检测。基于已发表的相关文献和联川生物降解组测序平台,该文对降解组测序技术应用于植物miRNA靶基因的研究进展及其实验原理进行了综述,同时对运用该技术可进行的更深入研究进行了讨论。