长穗偃麦草DREB类基因EeAP2.2的克隆与序列分析

由于一些基因的特殊碱基序列限制，使得应用一种技术获得基因的全长cDNA序列比较困难。本研究结合RACE和GenomeWalking技术从十倍体长穗偃麦草（Elytrigiaelongata，2n=70）中克隆了AP2家族的一个全长cDNA序列，命名为EeAP2.2。序列分析表明，该基因具有一个837bp的开放阅读框，编码279个氨基酸残基，含有一个保守的AP2结构域，是AP2大家族的一个新成员。该基因编码的氨基酸序列与GenBank已有的普通小麦AP2家族两个同源基因编码蛋白TaDREB1和TaDREBW50（登录号分别为：AAL01124.1和AAY44605.1）具有98%的氨基酸序列一致性，与大麦AP2蛋白HvDREB1-a（登录号AAY25517.1），高羊茅AP2蛋白FaDREB2A（登录号CAG30547.1）及水稻OsDREB2.2（登录号AY064403）的氨基酸序列一致性分别为93%、86%、69%。说明该基因与小麦AP2家族基因的同源性最高。本研究除获得了长穗偃麦草一个重要抗逆转录因子基因EeAP2.2的全长cDNA序列外，也提供了一种快速、有效克隆功能基因的方法。