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ISSN: 2333-9721
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菜豆ANK基因家族鉴定及ANK25的表达模式分析

Keywords: ANK重复序列,生物信息学,亚细胞定位,表达模式,菜豆

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Abstract:

锚蛋白重复序列模体是生物体内最普遍的蛋白质序列模体之一,在多种细胞活动中主要介导蛋白质-蛋白质的相互作用。利用菜豆基因组数据库,通过生物信息学手段对菜豆ANK家族成员及分子生物学特性鉴定。菜豆基因组中含有30个ANK家族基因,分布于9条染色体上,其中第五条染色体上含有ANK的基因最多,包含13个基因。蛋白结构域分析发现ANK25除了含有ANK结构域外还含有RING结构域。据报道,RING蛋白主要参与基因转录调控、DNA修复和重组等。亚细胞定位结果显示,ANK25主要分布在细胞膜上。表达模式分析发现,ANK25对干旱、盐和ABA胁迫有响应。本研究为进一步研究菜豆ANK的分类及功能提供了有利的依据。

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