陆地棉矮化突变体Ari1327茎尖的转录组分析

为了从分子水平上研究陆地棉矮秆突变体Ari1327的矮化机理，本研究以矮秆突变体Ari1327、野生型Ari971和高秆突变体Ari3697的茎尖为材料，建立3个cDNA文库，用IlluminaHiSeqTM2000系统对3个材料的茎尖cDNA进行转录组测序。3个文库测序共得4.9G数据量，拼接得到Unigene70877个。通过矮化突变体Ari1327与野生型Ari971和高杆突变体Ari3697两个文库的差异筛选，得到13919个与矮化相关的差异表达基因，其中5406个上调，8513个表现下调。GO功能和KEGG通路富集发现，差异基因在植物激素信号转导途径显著富集。通过实时荧光定量PCR（qRT-PCR）验证，本研究推测Ari1327的矮化可能与赤霉素和生长素两种激素的信号转导及互作有关。转录组测序得到的大量差异基因，为深入研究棉花的矮化机理具有重要参考价值，同时为棉花的矮化育种工作奠定了基础。