编码美洲螯龙虾肽聚糖识别蛋白（pgrp）cdna的电子克隆及其生物信息学分析

利用电子克隆方法，获得编码美洲螯龙虾（homarusamericanus）肽聚糖识别蛋白（peptidoglycanrecognitionprotein,pgrp）的cdna序列及相应的氨基酸序列；采用生物信息学方法对其进行基本理化性质、亲疏水性、信号肽、二级结构、细胞定位、三级结构等的分析。结果获得一段长920bp的编码美洲螯龙虾pgrp的cdna序列，包含一个长834bp的开放阅读框，编码277个氨基酸；编码蛋白是含有信号肽的分泌蛋白，含有1个c端pgrp结构域，表明是一种pgrp；分析结果显示该蛋白与黑腹果蝇（drosophilamelanogaster）短型pgrp-sc2和pgrp-sd比较相似。