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ISSN: 2333-9721
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草鱼α-淀粉酶基因5,侧翼序列克隆与分析

DOI: 10.3969/j.issn.2095-0780.2014.05.013, PP. 87-93

Keywords: 草鱼,α-淀粉酶基因,genomewalking,5'侧翼序

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Abstract:

应用pcr和genomewalking技术克隆获得长度为168bp的草鱼(ctenopharyngodonidellus)α-淀粉酶基因外显子ⅰ序列和2063bp的5'侧翼序列。将草鱼α-淀粉酶基因外显子ⅰ序列与已知几种鱼类α-淀粉酶基因外显子ⅰ序列比对,相似度为68%~86%。将草鱼α-淀粉酶基因5'侧翼序列进行生物信息学分析,确定了其转录起始区域及转录起始位点(tss);在tss上游30bp处有1个tata-box,-58bp处有ccaat-box;在5'侧翼序列中还发现有gata-1、oct-1、gr、hnf-3、ap1和sp1等转录因子结合位点。草鱼α-淀粉酶基因5'侧翼序列的克隆,为进一步研究不同食性鱼类α-淀粉酶基因侧翼序列的差异、鱼类α-淀粉酶基因的表达、功能及调控机理奠定基础。

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