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南方水产科学 2015
滁州鲫线粒体细胞色素b基因和控制区序列比较及其系统进化分析DOI: 10.3969/j.issn.2095-0780.2015.02.015, PP. 101-108 Keywords: 滁州鲫,细胞色素b,控制区,系统进化分析 Abstract: 采用pcr产物直接测序法测定了14尾滁州鲫(carassiusauratusgibelioinchuzhou)的线粒体细胞色素b(cytochromeb,cytb)基因和控制区(d-loop)全序列,长度分别为1141bp和924bp,且均无核苷酸变异位点。cytb基因的t、c、a和g含量分别为29.2%、27.8%、28.5%和14.5%;d-loop的t、c、a和g含量分别为33.2%、20.1%、32.6%和14.1%。2种序列中a+t含量(57.7%,65.8%)均明显大于g+c含量(42.3%,34.2%),且g含量偏低,显示了与其他水生动物线粒体核苷酸碱基含量相似的特征。通过对滁州鲫的控制区结构进行分析,识别了其终止序列区(etas)、中央保守区(cd)和保守序列区(csb)的关键序列。滁州鲫与其他鲫属鱼类的cytb和d-loop序列均具有高度的相似性,分别为93%-100%和94%-99%。基于2种序列的分子系统进化树分析均表明,滁州鲫与方正鲫(carassiusauratusgibelioinfangzheng)亲缘关系最近,而与来自日本的鲫类群亲缘关系最远。
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