2种虾虎鱼细胞色素b基因全序列克隆与分析

测定了矛尾刺虾虎鱼（acanthogobiushasta）和红狼牙虾虎鱼（odontamblyopusrubicundus）的线粒体细胞色素b(ctyb)基因全序列。2种虾虎鱼cytb基因序列全长均为1141bp，通过序列比对，检测到266个变异位点，序列中碱基转换频率高于颠换，碱基替换主要发生在密码子第3位。结合genbank中的虾虎鱼科其他物种的细胞色素b基因全序列，利用kimura-双参数模型分析遗传距离表明，10种虾虎鱼科鱼类的遗传差异在0.118~0.330之间，大头新虾虎鱼(neogobiuskessleri)与同属的裸喉新虾虎鱼(n.gymnotrachelusis)遗传距离最小，为0.118；大头新虾虎鱼和矛尾刺虾虎鱼遗传距离最大，为0.330。以cytb基因全序列构建的nj进化树分析表明，10种虾虎鱼分为3个主要类群，红狼牙虾虎鱼和矛尾刺虾虎鱼聚为1支，且与其余8种虾虎鱼类遗传距离较远。