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ISSN: 2333-9721
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江豚线粒体cytb和d-loop片段的序列分析及其分子系统学研究

DOI: 10.3969/j.issn.1673-2227.2009.05.005, PP. 24-31

Keywords: 江豚,cytb,d-loop,系统发育

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对江豚(neophocaenaphocaenoides)mtdna的cytb(377bp)和d-loop(343bp)片段进行了测序和分析,并与genbank中鼠豚类及一角鲸类同源序列进行了比较。研究结果表明,cytb基因片段的碱基组成平均为t:29.0%,c:28.8%,a:27.2%,g:15.0%;d-loop片段的碱基组成平均为t:35.9%,c:21.8%,a:32.4%,g:9.9%。cytb基因片段共出现109个变异位点,简约信息位点107个,序列变异度为28.9%,碱基替代主要发生在密码子第3位点上,转换/颠换为13.3;d-loop片段共有109个变异位点,简约信息位点100个,序列变异度为31.8%,转换/颠换为2.4。构建的系统发育树显示,江豚是鼠豚科中较早分化出来的一个类群,与一角鲸科的亲缘关系最近。2个片段序列的分析结果一致,棘鳍鼠海豚phocoenaspinipinnis、太平洋鼠海豚p.sinus和黑眶鼠海豚australophocaenadioptrica聚为一支。

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