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南方水产科学 2009
4种鳕鱼线粒体16s?rrna、coi和cyt?b基因片段序列的比较研究DOI: 10.3969/j.issn.1673-2227.2009.03.008, PP. 46-52 Keywords: 鳕鱼,16srrna基因,coi基因,cytb基因,序列分析 Abstract: 对狭鳕(theragrachalcogramma)、太平洋鳕(gadusmacrocephalus)、蓝鳕(micromesistiuspoutassou)和远东宽突鳕(eleginusgracilis)4种不同属鳕鱼的线粒体16srrna、cytochromeoxidasesubuniti(coi)和细胞色素b(cytb)基因片段序列进行了测定,分析比较了不同鳕鱼种间的序列差异。通过pcr扩增和序列测定,得到4种鳕鱼线粒体3个基因片段的总长度分别为539bp(16srrna)、601bp(coi)和385bp(cytb),其基因片段的a+t含量都较高。4种鳕鱼种内个体间序列变异较小,3个基因片段的核苷酸替代速率依次为cytb>coi>16srrna。cytb基因片段序列的分析结果显示太平洋鳕和狭鳕间分歧时间约为219万年,发生于中新世(miocene);宽突鳕与蓝鳕间分歧时间约为653万年,发生在上新世(pliocene)。根据遗传距离构建的nj系统树表明,狭鳕与太平洋鳕的亲缘关系较近,与蓝鳕的亲缘关系较远。
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