2个尼罗罗非鱼群体ghsr基因5′侧翼序列的多态性及其遗传多样性分析

该试验以快长尼罗罗非鱼（oreochromisniloticus）和普通尼罗罗非鱼2个群体为研究对象，通过pcr扩增与测序，获得ghsr基因5′侧翼区序列77条，片段大小为1217bp。共检测出变异位点57个，包括12个插入/缺失位点和45个多态性位点。共发现16种单倍型，其中hap2可能为原始单倍型。16种单倍型在进化树中聚为a和b2支，a支中有11种单倍型，在普通群体和快长群体中均有分布，但快长群体中所占比例较高；b支中有5种单倍型，均分布于普通群体中。遗传多样性参数显示普通尼罗罗非鱼群体的核苷酸多样性（pi）、单倍型多样性（hd）和平均核苷酸差异数（k）都高于快长尼罗罗非鱼群体。amova分析结果显示快长和普通尼罗罗非鱼2个群体之间的fst为-0.2000（p>0.1），表明2个群体间遗传分化不明显，且2个群体的遗传差异主要来自群体内（120%）。