萝卜中一种新dsrna的全长cdna克隆及序列分析

从一点红萝卜品种（raphanussativus-rootcv.yidianhong）叶片中提取dsrna，应用spat方法对各dsrna条带进行cdna克隆并测序，除获得先前报道的5条序列（rasr1-rasr5）以外，还得到一条新的全长序列，将其定名为rasr6（eu285027）。序列分析结果表明：rasr6全长为1778bp，其正义链编码1个由502个氨基酸组成、分子量约为55.1kda的蛋白质。该序列与前人报道的双分病毒科5个病毒序列具有相似性，且它们均编码双分病毒科病毒的外壳蛋白(cp，capsidprotein)。核苷酸序列比对结果显示：rasr6与同时来源于萝卜的rasr1和rasr2的5'utr序列高度同源，且其3'末端具有polya结构，而与rasr3、rasr4和rasr5的utr则没有明显的相似性。因此，我们推测rasr6与rasr1、rasr2同属于双分病毒rasv1（raphanussativusvirus1），它可能与rasr2共同编码该病毒的cp或作为rasv1的卫星rna存在。