番茄s-腺苷蛋氨酸脱羧酶基因slsamdc1的克隆与序列分析

以蔓陀罗s-腺苷蛋氨酸脱羧酶全长cdna序列为信息探针,筛选ncbi番茄est数据库,依据同源est信息，经人工拼接、rt-pcr及race技术验证，获得了1个新的samdc基因家族成员，命名为slsamdc1(genbank登录号：ef550528)，并利用染色体步移技术克隆了879bp的上游调控区域。slsamdc1cdna序列全长1847bp,5′-utr和3′-utr分别长523bp、241bp；存在3个orf(微型uorf、小型uorf和主orf)，主orf编码360个氨基酸的samdc酶原；slsamdc1基因组序列全长3648bp，有3个内含子，均位于5′-utr，所有内含子的剪切位点均符合真核生物“gt-ag”规则。slsamdc1基因与其它植物来源samdc基因同源性较高，与人、大肠杆菌以及酵母的同源性较低。表达谱分析发现，slsamdc1基因在番茄根、茎、叶、花蕾、果实等器官中均表达，果实中的表达量相对较高。生物信息学分析表明，slsmdc1基因的上游调控序列存在多个顺式作用元件，如w-box、tata-box、caat-box等。