马铃薯花青素转录激活基因stwd40的克隆与表达分析

根据genbank中报道的茄属植物矮牵牛花青素wd40类转录激活基因an11及番茄wd40基因113964r的mrna序列的保守区结构，设计简并引物，从紫色马铃薯皮中克隆了马铃薯wd40类转录激活基因的保守片段，再分别利用race技术获得了该基因的3'端和5'端。序列分析表明，该基因核苷酸序列为1292bp，具有完整的编码框，推导其编码362个氨基酸，命名为stwd40。推测的氨基酸序列与genbank数据库中大量物种的花青素转录激活蛋白stwd40有较高的同源性，其中与矮牵牛的花青素转录调控基因an11的相似性达86%。rt-pcr表达分析显示stwd40在紫色马铃薯叶、茎、皮、肉及根中都有表达，其中在茎中的表达量最高，肉中表达量最低，且在白色马铃薯的叶、皮和肉中也有表达，推测该基因为组成型表达。