滇黑两省黄瓜花叶病毒南瓜分离物外壳蛋白基因序列分析

利用免疫捕捉多聚酶链式反应(immuno-capturepcr,ic-pcr)方法从南瓜的两个黄瓜花叶病毒(cucumbermosaicvirus,cmv)云南分离物(cmv-yn)和黑龙江分离物(cmv-hlj)中扩增获得约700bp的外壳蛋白(coatprotein,cp)基因片段,并克隆到pgem-t载体中。核苷酸序列测定表明,cmv-hlj和cmv-yn两个分离物cp基因长为657bp,编码219个氨基酸,两个分离物的核苷酸和氨基酸同源性分别达到96.8%和97.4%。和国外cmv亚组ⅰ6个分离物核苷酸序列同源性在90%以上,氨基酸同源性在97%以上,和亚组ⅱ6个分离物的同源性分别为66.4%和73.4%。和国内亚组ⅰ10个分离物的核苷酸同源性都在89.5%以上,氨基酸同源性在93%以上,而和亚组ⅱ两个分离物的同源性分别为68.3%和73.5%。序列分析结果表明cmv-hlj和cmv-yn两个分离物属于cmv亚组ⅰ。