辣椒种质资源its与系统进化分析

以核糖体dna内转录间隔区（internaltranscribedspacer，rdnaits区）作为dna条形码对辣椒进行系统进化分析。利用收集的17份辣椒资源，提取总dna，进行pcr扩增和测序，并从genbank下载辣椒属的主要栽培种浆果状椒（capsicumbaccatum）、茸毛椒（c.pubescens）、灌木状辣椒（c.frutescens）和野生种（c.eximium）、野生种（c.lycianthoides）的its序列，进行系统进化与亲缘关系分析。结果表明，以野生种（c.eximium）的its序列为参考序列，利用clustalx2.1软件进行比对，发现3个中华辣椒、茸毛椒和灌木状辣椒在its1区有15个碱基缺失。以茄科番茄属（lycopersicon）栽培种‘上海906’作为外类群，在进化树标尺约0.11处，22个辣椒属its序列可分为6个分支。全部一年生辣椒（14个）聚在一支。中华辣椒（3个）和灌木状辣椒聚在一支，表明中华辣椒与灌木状辣椒亲缘关系相对较近。野生种（c.eximium）、浆果状椒、茸毛椒和野生种（c.lycianthoides）分别单独为一支。