低温胁迫下西瓜同源二倍体和三倍体甲基化及基因表达的差异分析

为了揭示西瓜二倍体及三倍体在低温胁迫下的耐冷性分子机制，以西瓜二倍体自交系‘83166’（‘京欣1号’品种的母本）及其同源三倍体为材料，利用msap及cdna-aflp技术研究低温处理前后基因表达的差异，并对差异带进行克隆、测序和比对。28对msap引物扩增得到2356个位点，其中二倍体经低温处理后总甲基化率下降8.5%，三倍体下降10.4%。将13条差异带与西瓜基因组数据库比对，有7条带确定是西瓜基因组序列。26对cdna-aflp引物组合扩增出1267条带，其中二倍体上调表达占48.2%，下调表达占51.8%；三倍体上调表达占51.3%，下调表达占48.7%。21条差异带在ncbi中找到了同源序列基因，包括假定蛋白（38.1%）、能量与代谢（38.1%）、信号转导（9.5%）、物质运输（9.5%）以及dna修饰（4.8%），另有9条无同源序列。低温胁迫后，三倍体去甲基化率与上调表达量均大于二倍体，而且三倍体诱导出更多的差异基因参与了能量代谢调控、信号转导、物质运输等过程，说明在抵御低温胁迫中三倍体比二倍体有更强的耐冷性。