两种snp分型方法的比较及其在柚品种鉴定中的应用

用两种常用的snp分型方法，等位基因特异性pcr法（allele-specificpcr，as-pcr）和高分辨率熔解曲线分析（highresolutionmeltinganalysis，hrma），对16个柚栽培品种和8个柚杂种后代材料进行了7个snp位点的分型研究。结果表明这两种方法所得的分型结果相同，都将24个样本分成了22种基因型。值得一提的是，样本‘八朔’与‘红八朔’，‘红甘夏’与‘川野夏橙’之间在所测位点无差别，表明其应当是同一来源的无性系变异。‘早熟真龙柚’和‘中熟真龙柚’的分型结果表明它们的基因型不同，看来并非是起源同一基因型的不同芽变品种，也不存在亲子关系。可见，as-pcr和hrma均适用于柚类品种的区分和鉴定。as-pcr法是一种准确、低成本的snp分型方法，适合普通实验室使用，惟对pcr反应体系要求严格。hrma分型法具有准确、快速、简便、分析量大的特点，但需要专门的设备，试剂成本也高。