百合肌动蛋白基因lilyactin的克隆与表达分析

为了在百合功能基因表达研究中选择一个理想内参基因，依据岷江百合cdna文库所获得的百合肌动蛋白（actin）基因的est序列，采用race技术进行该基因cdna全长克隆，并利用实时荧光定量pcr分析其在不同组织中的表达模式，获得百合肌动蛋白基因cdna全长序列（genbank登录号：jx826390），命名为lilyactin。该基因cdna全长1367bp，其中，5′非编码区91bp，3′非编码区233bp，开放读码框1134bp，编码377个氨基酸。序列比对发现，该基因与其它15种植物肌动蛋白核苷酸序列的相似性均在80%以上，氨基酸序列的相似性达98%。进化分析显示，百合肌动蛋白与郁金香肌动蛋白的亲缘关系最近。实时荧光定量pcr结果显示，该基因在百合的花蕾、叶片和鳞片组织中恒定表达，表明相对于其他物种的内参基因，lilyactin更适宜作为百合属植物的内参基因。