芋花叶病毒的rt-pcr检测及外壳蛋白基因序列分析

采用rt-pcr技术对采自中国湖北、浙江和山东的91份芋[colocasiaesculenta（l.）schott]样品的芋花叶病毒（dasheenmosaicvirus，dsmv）进行了检测，检出率为26.4%。对其中14个dsmv分离物的317bp扩增产物（为外壳蛋白基因的一部分）序列分析的结果显示，各分离物内的核苷酸变异相对较低，而分离物间存在较大的分子变异，相似性为68.3%~97.8%。对来自湖北和浙江的2个dsmv分离物dsmv-scs和dsmv-jh的外壳蛋白基因（coatproteingene，cp）进行了测序，全长分别为951bp和987bp，二者cp核苷酸和氨基酸序列相似性分别为79.0%和82.3%，与已报道dsmv的cp核苷酸和氨基酸序列相似性分别为73.0%~92.1%和74.8%~98.2%，在构建的系统发育树上聚在两个不同的簇，各dsmv分离物的系统进化关系与其寄主和地理来源无显著相关性。