苹果mdglrs家族基因生物信息学鉴定和表达分析

利用生物信息学策略对苹果mdglrs家族基因编码蛋白的氨基酸序列的基本特征、二级结构、跨膜区域、亲疏水性、基因亚细胞定位及保守结构域进行了预测和分析，与拟南芥atglrs家族的20个基因进行了氨基酸序列比对和进化树分析，并对这些基因在不同营养生长器官中进行了表达分析。结果表明，苹果mdglrs家族包含32个基因，分为3个亚族，大部分基因编码800个氨基酸以上，多含有3个跨膜区域，二级结构主要以α–螺旋、无规则卷曲、折叠延伸链为主；亚细胞定位预测发现，mdglrs蛋白主要定位在内质网和质膜上；mdglrs蛋白的保守结构域是s1-m1-m2-m3-s2-m4；大多数基因在根、茎、叶中普遍都有表达，在叶中的表达量最高。