|
园艺学报 2012
芹菜非特异性脂转移蛋白基因的克隆与表达分析Keywords: 芹菜,脂转移蛋白,基因克隆,实时定量pcr,基因表达 Abstract: 以芹菜(apiumgraveolens)‘六合黄心芹’、‘津南实芹’和‘美国西芹’为试验材料,采用rt-pcr技术分别获得其cdna序列。序列分析表明:来源于3个芹菜品种的非特异性脂转移蛋白(non-specificlipidtransferprotein,nsltp)基因核苷酸序列高度保守,全长357bp,编码118个氨基酸,起始密码子atg之后含有27个氨基酸残基的信号肽序列,推测其成熟的蛋白含91个氨基酸残基,预测其蛋白质分子量为11.75kd,pi值为9.36。芹菜的nsltp蛋白主要由α–螺旋和随机卷曲组成。空间结构上分析显示,芹菜nsltp蛋白中h1区域明显分为h1a和h1b两个亚区域,而模板碧桃中h1区域为一个连续的螺旋结构,存在明显的差异。进化分析显示,芹菜nsltp与香石竹、大洋洲滨藜等植物的nsltp相似性较高,在保守位置具有8个半胱氨酸残基。实时定量pcr表达分析表明,该基因主要在芹菜的茎以及茎尖生长活跃中心表达,具有明显的组织特异性。
|