银杏基因组dna甲基化修饰位点的msap分析

利用ecorⅰ和hpaⅱ/mspⅰ双酶切建立适合于银杏基因组的甲基化敏感扩增多态性（methylation-sensitiveamplificationpolymorphism，msap）分析体系，在全基因组水平检测银杏dna甲基化修饰水平、模式及位点等表观遗传信息。结果显示，从54对msap选扩引物中，选出16对msap引物组合，共扩增产生454条清晰可辨且可重复的dna条带，平均每对引物扩增获得28.38条带。在全部扩增位点中，检测到甲基化位点200个，ccgg/ggcc位点甲基化修饰比例为44%。部分银杏基因组甲基化修饰位点进行回收，最终分离了18条存在甲基化修饰的基因组dna序列。blastn比对分析表明，银杏基因组中包括转录调控因子、反转录转座子、通道蛋白、启动子结合蛋白、蛋白激酶等在内的多种类型的dna序列中均存在dna甲基化修饰现象。