梨贝壳杉烯氧化酶基因ppko的克隆及生物信息学分析

以黄金梨（pyruspyrifolianakai）茎尖为试材，应用同源克隆和race方法从梨茎尖中克隆到赤霉素合成代谢的关键酶：内根-贝壳杉烯氧化酶（ko）基因cdna的全长序列，命名为ppko，genbank登录号为：hm003112，其长度为1752bp。ppko的开放阅读框（orf）编码515个氨基酸，相对分子量为59.007kd，等电点为7.19。氨基酸同源性分析表明，ppko与已报道的其它植物的ko氨基酸序列具有59.4%~95.9%相似性；氨基酸聚类分析表明，梨和苹果首先聚类，其次是草莓；生物信息学分析表明：ppko含有细胞色素p450核心功能域fxxgxrxcxg和氨基端的跨膜结构域。