|
园艺学报 2012
宽皮柑橘单核苷酸多态性的高分辨率熔解曲线分型, PP. 777-782 Keywords: 宽皮柑橘,高分辨率熔解曲线,单核苷酸多态性,基因分型 Abstract: 高分辨率熔解曲线分析(highresolutionmeltinganalysis,hrm)可以检测单碱基改变引起的dna双链熔解温度(tm)值变化,从而可以对样本在单核苷酸多态性分子标记(singlenucleotidepolymor-phism,snp)上进行基因分型。通过分析ncbi数据库中宽皮柑橘的表达序列标签(expressedsequencetag,est)数据鉴别snp位点,并用小片段扩增法高分辨率熔解曲线分型技术(highresolutionmeltinganalysisofsmallamplicons)分析11个宽皮柑橘(citrusreticulata)品种以及柳橙(citrussinensisosbeckvar.‘liucheng’)的5个snp位点的基因型。结果显示,小片段扩增法高分辨率熔解曲线分型可以快速、清楚地分辨纯合与杂合基因型,在校正温度差异后也可以很好地分辨同一个snp位点不同的纯合型。统计分析表明样本在所有snp位点上均存在多态性,5个snp位点的平均多态性信息含量(pic)为0.3190,显示样本在这组snp位点上具有较高的杂合率。
|