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ISSN: 2333-9721
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园艺学报  2009 

‘岩溪晚芦’椪柑果皮与果肉差减cdna文库的构建及初步分析

, PP. 967-974

Keywords: 柑橘,抑制性差减杂交(ssh),cdna文库,表达序列标签,克隆,差异表达基因

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Abstract:

以‘岩溪晚芦’(citrusreticulatablanco)成熟果皮和果肉为材料,采用抑制性差减杂交技术,成功构建了果皮(tester)与果肉(driver)的差减cdna文库。结果显示:cdna克隆外源插入片段大小介于100~500bp之间。成功对411个克隆进行了测序,测序结果经与ncbi基因库中序列进行比较,377个est找到了同源序列,它们分属于126个基因,涉及到与色素合成、能量代谢、初级代谢、次生代谢、抗逆防御、蛋白代谢、信号转导、香味形成、果皮软化(衰老)、精油合成、抗氧化代谢等代谢途径和生理生化过程。还有一些基因涉及到三价铁螯合物、反转录转座子gag蛋白、查尔酮合成、硼离子转运、儿茶酚氧位甲基转移酶等功能。功能已知且没有重复的est共有63个,占总数的49.2%。有5个基因共62个克隆虽在blast搜索时找到了较高的同源性序列,但功能目前尚未明确,有待进一步深入分析。另有34个基因未搜索到同源序列,可能为新发现的基因。

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