侵染白菜的黄瓜花叶病毒分离物基因组的全序列分析

对浙江省杭州地区白菜（brassicacampestrisl.ssp.chinensisvar.commuistsenetlee.）上获得的cmv分离物（cmv-ctl）进行了全长克隆和基因组序列分析。结果显示：cmv-ctl的rna1（genbank序列号：ef213023）全长为3357个核苷酸（nt），编码993个氨基酸（aa）的1a蛋白；rna2（genbank序列号：ef213024）全长为3047nt，编码858aa的2a蛋白和111aa的2b蛋白；rna3（genbank序列号：ef213025）全长为2217nt，编码278aa的mp蛋白和218aa的cp蛋白。序列相似性分析表明，cmv-ctl与cmv亚组ib中株系ia相似性最高，rna1、rna2和rna3与该株系的相似性分别为91.3%、91.3%和93.6%。cp基因和rna3的5'ntr核酸序列系统发生树分析表明，cmv-ctl与中国大多数cmv分离物一样，属于cmv亚组ib。