基于est信息的百合ssr标记的建立

依据已知的百合est（expressedsequencetags）序列信息,开发新的ssr(simplesequencerepeats)标记,在ncbi的est数据库1688est中检索到98条含有101个ssr的序列,ssr的检出率为5.98%，其中三核苷酸重复类型占主导地位，出现频率为2.84%。est-ssr的重复基元共搜索到47种，其中三核苷酸重复基元类型最为丰富，大约占重复基元类型总数的一半。利用部分est-ssrs序列共设计23对ssr引物,以铁炮百合‘snowqueen'dna为模板，对引物进行筛选，其中18对引物有扩增产物,占所设计引物总数的78.26%；进一步用这些引物在5个杂种系列13个百合品种进行多态性测试，显示多态性的引物占可扩增引物的66.7%。本研究结果证明了基于百合est信息建立ssr标记是一种有效而又可行的方法。