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ISSN: 2333-9721
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园艺学报  2008 

香蕉穿孔线虫β-1,4-内切葡聚糖酶基因的克隆与特征分析

, PP. 1431-1440

Keywords: 香蕉穿孔线虫,香蕉,β-1,4-内切葡聚糖酶,ghf5家族,原位杂交

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Abstract:

植物寄生线虫的分泌物在线虫的侵染过程中具有重要的作用,其中纤维素水解酶是研究的较多的主要分泌物之一。采用rt-pcr和race方法,从香蕉穿孔线虫(radopholussimilis)中获得编码β-1,4-内切葡聚糖酶基因的cdna序列,命名为rs-eng-1(genbank登录号为eu414839)。该cdna序列全长为1630bp,包含一个1404bp的开放阅读框(orf),编码含467个氨基酸的蛋白,理论分子量与等电点分别为48.22kd和6.04。序列分析表明该酶含有糖基水解酶家族5(ghf5)的保守结构域,n端具有22个氨基酸残基组成的信号肽,c端含有细菌式样的纤维素结合域(cbdⅱ)。原位杂交结果显示此基因在相似穿孔线虫的食道腺部位表达,并且southern结果显示其为多拷贝基因。cdna与基因组dna重叠分析表明,此基因包含6个内含子,切割点符合5'-gt...ag-3'的规律。进化分析显示该酶与细菌bacillussubtilis和erwinacarotovora分泌的纤维素酶属于同一支,推测其来源于细菌的水平基因转移。

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