草莓轻型黄边病毒的rt-pcr检测及其3'端序列分析

利用rt-pcr技术对草莓植株中草莓轻型黄边病毒(smyev)的外壳蛋白基因片段进行特异扩增,扩增产物经测序证明为smyev的特异片段。建立了稳定的smyev的rt2pcr检测体系,并对19个草莓品种和2种野生草莓进行检测,其中12个品种和五叶草莓带有smyev。从smyev的沈阳分离物sy01上扩增出了932bp的基因组3'末端区域,其核酸序列与国外分离物的序列同源性为86%～96%。系统进化树显示smyev分为3个组群,沈阳分离物sy01与欧美分离物位于同一组群内,但独立形成1个小的分支。rna二级结构分析显示smyev基因组3'末端形成3个茎环结构,不同分离物的序列变化并未引起茎环结构的明显变化。