结球甘蓝核基因组密码子使用偏爱性分析

根据甘蓝测序结果，利用codonw软件对结球甘蓝的48000个蛋白质编码基因序列进行了分析，计算出同义密码子相对使用频率，确定了tct、cct、aga、gtt、gct、gat等6个高频密码子。将甘蓝与大肠杆菌、拟南芥、棉花、水稻的密码子使用频率进行了比较，发现甘蓝密码子使用偏爱性与同为双子叶植物的拟南芥、棉花基本一致，而与大肠杆菌及单子叶植物水稻均具有较大差异。以甘蓝密码子用法分析结果为依据，对btcry1c抗虫基因进行了密码子的改造，得到了具有甘蓝密码子使用特点的cry1c基因序列，为甘蓝的转基因研究奠定了分子基础。