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ISSN: 2333-9721
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园艺学报  2013 

caps与熔解曲线技术相结合的菜薹snp基因分型体系的建立与验证

, PP. 1916-1927

Keywords: 菜薹,酶切扩增多态性序列,熔解曲线,单个核苷酸多态性,高通量基因分型

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Abstract:

根据不同长度或不同碱基序列的dna片段的熔解温度(tm)不同的原理,将酶切扩增多态性序列(cleavedamplifiedpolymorphicsequence,caps)与熔解曲线(meltingcurve,mc)技术相结合,建立了caps-mc技术,从而实现snp分子标记基因分型。通过菜薹‘l58’和紫菜薹‘zct095’的基因组重测序数据与白菜基因组的参考序列(‘chiifu-401-42’的基因组序列)的比对,预测了719个hindⅲ内切酶识别碱基序列的snp位点,并将其设计成caps-mc分子标记,从中随机选择10对标记进行体系建立与优化,结果显示本体系有灵敏度强、精准性高、快速、高通量、经济实用等优势。

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