蝴蝶兰est资源ssr标记分析与开发

利用ssrit软件对ncbi上蝴蝶兰的8188条est序列按照碱基重复单元数8以上的标准进行ssr位点查找，发掘出246条est序列，共含有261个ssr位点，检出率为3.19%。二核苷酸重复是最主要的重复类型，占ssr总数的94.25%。ssr的不同重复单元中，最常见的重复单元是：(ta)n和(ga)n，其余出现频率较高的依次为(tc)n、(at)n和(ag)n。设计了32对est-ssr引物，以蝴蝶兰品种‘v31’的dna为模板进行pcr扩增，发现16对引物能扩增出预期产物。进一步用这16对引物对16个蝴蝶兰品种（系）进行pcr扩增，9对引物有多态性，多态性条带数在2~12个之间。结果表明，设计开发的蝴蝶兰的est-ssr标记是有效的。