白菜型油菜和菜薹的indel标记开发及其rils群体遗传连锁图谱的构建

通过白菜型油菜‘r-o-18’和菜薹‘l58’的基因组重测序数据与白菜基因组的参考序列（‘chiifu-401-42’的基因组序列）的比对，在全基因组范围内检测到了18479个短插入缺失变异位点（≤5bp）。从中挑选了500个插入/缺失片段为4~5bp的indel变异位点，将其设计成indel分子标记并进行试验验证，结果有452个标记通过pcr扩增出单一条带，但仅有106个在‘r-o-18’和‘l58’间表现出多态性，346个没有多态性，48个在pcr中没有扩增。亲本间具有多态性的106个indel标记可用来检测以‘r-o-18’和‘l58’为亲本构建的rils基因型，并构建了一张包含99个标记的遗传连锁图谱。