|
园艺学报 2012
基于its序列石斛材料的鉴定及系统进化分析Abstract: 以核糖体dna内转录间隔区(internaltranscribedspacer,rdnaits区)作为dna条形码对石斛种进行鉴定,并进行系统进化分析。收集获得43个石斛样品,其中35个为已知鲜样品,8个为待确定种的干样品。从35个鲜品中获得在genbank中未公布的海南石斛、华石斛以及秋石斛中的两个品种‘白花红心秋石斛’和‘紫红条纹秋石斛’its序列。its序列差异与形态特征的关系分析,结果显示,its同源性的高低,与形态的相似性成正相关。以舌唇兰属为外类群,并从genbank中获得其他20个石斛种的its序列,对35个已知样品和8个待检测样品进行分析。结果显示,35个已知样品分为5支,其中大部分石斛种(24个)聚在一支。竹叶石斛和苏瓣石斛聚在一支;华石斛、聚石斛和小黄花石斛聚在一支;短棒石斛单独为一支;竹枝石斛与‘白花红心秋石斛’和‘紫红条纹秋石斛’聚在一支;海南石斛和木石斛聚在一支。根据its序列,大多数样品分组与传统分组相同,但按传统分组不在石斛组的重唇石斛、钩状石斛、鼓槌石斛和叉唇石斛分在了石斛组,并确定了檀香石斛分在石斛组。确定了8个石斛干样品所属的种。
|