苹果wrky转录因子家族基因生物信息学分析

利用生物信息学方法对苹果mdwrky转录因子家族成员、基因分类、染色体定位、系统进化关系和结构域序列保守性进行了预测，并分析基因在果实成熟期和砧穗互作中的表达差异。苹果mdwrky家族包含116个基因，分为groupⅰ、groupⅱ和groupⅲ，其中groupⅱ又可细分为groupⅱa、groupⅱb、groupⅱc、groupⅱd和groupⅱe亚类；苹果的17条染色体均有wrky转录因子分布，其中第1条染色体上的分布最多，有12个wrky基因分布。mdwrky编码的蛋白在118~965个氨基酸范围内，等电点位于4.81~10.16之间。microarray分析发现，在苹果果实成熟时期和砧木接穗互作过程中，多数mdwrky基因的表达都有不同程度的变化。