基于梨贝壳杉烯氧化酶基因ppko序列的功能性snp标记

基于基因序列的功能性标记是基因分型、图谱定位和相关性状标记辅助选择的理想标记。以‘矮生梨’ב茌梨’的梨杂交分离群体和9个梨栽培品种为试材，以梨赤霉素合成代谢途径的关键酶基因——贝壳杉烯氧化酶基因（ppko）的cdna序列为基础，设计5对pcr引物，通过高通量熔解曲线（highresolutionmelting，hrm）分析，筛选到可对基因进行良好分型的1对引物。通过对杂种后代和测试品种的测序分析表明，此对引物的扩增子是一个位于ppko第8外显子上的长度为200bp的序列，从中共检测到两处单核苷酸多态性（singlenucleotidepolymorphism，snp）变化，且均为非同义csnp。这两处snp标记均可以作为适合高通量分析的遗传标记在遗传作图、基因定位或资源鉴定中加以利用。