毛竹est资源ssr标记分析与筛选

对来源于ncbi公共数据库的非冗余3087条毛竹（phyllostachysedulis）est序进行简单重复序列ssr搜索发现：在401条毛竹est序列中共查找到408个ssr位点，平均6.8kbest序列中含有1个ssr。其中二核苷酸和三核苷酸重复是毛竹est-ssr的主要重复类型，分别占ssr总数的43.14%和49.75%。ssr的不同重复基序中，最常见的重复基序是：(ag)n，占37.01%，其余出现频率较高的依次为(tc)n、(agc)n、(gag)n和(cgc)n。根据搜索结果设计了182条毛竹est-ssr引物，以12个不同种属的竹子dna为模板，对引物进行了稳定性、通用性的验证与评价。结果表明有42对引物有较清晰且稳定的目标扩增产物，其中39对引物的产物存在多态性，说明设计开发的毛竹的est-ssr标记是可行且有效的。