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ISSN: 2333-9721
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园艺学报  2011 

香蕉根系均一化全长cdna文库的构建和鉴定

, PP. 1667-1674

Keywords: 香蕉,根系,均一化,cdna文库,基因,表达

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Abstract:

以香蕉幼苗根系为材料,利用dsn(duplex-specificnuclease)均一化技术与smart(switchingmechanismat5′endofrnatranscript)技术相结合,构建香蕉根系均一化全长cdna文库。经检测,初级文库滴度1.1×106cfu·ml-1,库容5×106个独立克隆,重组率大于95%,插入片段平均长度大于1kb,表明文库质量较好。随机挑取192个克隆进行est(expressedsequencetags)测序,成功获得179个高质量est,含5个conting和174个singlet,冗余度仅为2.35%。小规模测序拼接后获得145个unigenes,对unigenes分析结果表明文库的可靠性好。从序列比对结果中挑选3个与其它植物同源的抗逆基因,利用rt-pcr方法进行了干旱、低温及盐胁迫条件下基因表达分析,结果显示这3个基因在不同的逆境下差异表达。

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