一新MHCⅠ类等位基因存在于低等脊椎动物虹鳟鱼

根据已报道的鲑鳟鱼类MHCⅠ基因序列设计了扩增虹鳟鱼MHCⅠORF的引物对,采用RT-PCR克隆了18个虹鳟鱼的MHCⅠ基因,用Southernblot和Northernblot分析了其基因组中MHCⅠ的结构和在组织中的表达情况.结果显示10个MHCⅠ克隆序列与已报道的虹鳟鱼MHCⅠ基因序列(Onmy-UA-C32)有92.7%的同源性;而8个克隆序列与此仅有71.4%同源性,其代表克隆Onmy-UBA1长1140bp,含一完整的信号肽序列、成熟MHCⅠ区域和3′末端不转录区.Onmy-UBA1α2链序列分别与鲤科鱼类MHCⅠ有58.1%的同源性,与鲑鳟鱼类MHCⅠ则有75.3%的同源性.并且Onmy-UBA1在α2区域明显不同于已报道的Onmy-UA-C32.Southernblot分析结果表明,同源于鲤科鱼MHCⅠα2区域的基因探针(M1)和同源于鲑科鱼MHCⅠα2区域的基因探针(M2)其杂交带的大小和位置明显不同,这揭示了Onmy-UBA1与Onmy-UA-C32分别属于同一或不同基因座的等位基因.即研究发现了一新MHCⅠ类等位基因存在于最低等脊椎动物——虹鳟鱼.