簇毛麦新型低分子量谷蛋白亚基的分子克隆与序列分析

为发掘低分子量谷蛋白亚基（LMWGS）新的变异类型，通过设计引物和特异PCR扩增，从簇毛麦TA2127基因组DNA中得到14个LMWGS基因，GenBank登录号分别为HQ615147～HQ615160。序列分析表明，所有基因具有完整编码区，长度为831bp和846bp，可编码277和282个氨基酸残基，推导的氨基酸序列分析显示,14个基因编码的蛋白序列都缺少一段N端保守区，且N端序列是一种新的类型；在14个LMWGS基因中检测到19个SNPs和1个16bp的缺失。系统进化分析表明，簇毛麦LMWGS与ω醇溶蛋白和HMWGS亲缘关系相对较远，与普通小麦Glu3的低分子谷蛋白基因进化关系相对较近。